Initialement prévus à la fin de l'année 2023, les travaux de rénovation (désamiantage des façades et des plafonds, changement des baies vitrées...) du Centre Pompidou débuteront finalement fin 2025. La BPI fermera donc à partir d'avril 2025 pour être relogée dès la fin de l'été, et au moins jusqu'à la fin de 2029, au 40 avenue des Terroirs-de-France, à proximité du parc de Bercy, dans le 12^e arrondissement la capitale. 

Quelque 1 500 places de lecture assise sont prévues dans ce nouvel espace de 8 700 m², contre 10 400 m² au Centre Pompidou. Les horaires d'ouverture habituels sont conservés, à savoir de 12h à 22h en semaine (sauf le mardi) et de 10h à 22h les week-ends et jours fériés (sauf le 1^er mai). Ce nouvel emplacement est accessible en métro via la ligne 14, en bus, grâce aux lignes 24 et 64 ainsi qu'en tram avec le T3A.

Les travaux avaient été finalement reportés pour que l'établissement reste ouvert durant les Jeux olympiques 2024. Aucune rénovation n'avait été faite depuis le chantier mené de 1998-2000. La librairie du Centre Pompidou sera quant à elle simplement fermée.